Santos ocupa a quarta colocação no Ranking do Saneamento 2014, realizado em âmbito nacional pelo Instituto Trata Brasil. O município melhorou quatro posições em relação a 2013, quando ocupava o 8° lugar. No atual estudo, Santos está atrás apenas de Franca (1° lugar), Maringá, no Paraná (2°) e Limeira (3°), sendo a única entre as 20 melhores cidades com 100% nos indicadores Água, Coleta e Tratamento de Esgoto, e a segunda que recebeu mais investimentos desde 2008 (R$ 464,7 milhões).
O fornecimento de água e o sistema de coleta e tratamento de esgoto de Santos são operados pela Sabesp desde 1973. A empresa e a prefeitura da cidade atuam de forma conjunta por meio das secretarias de Meio Ambiente e de Serviços Públicos. Em 2014, a Semam registrou 116 ocorrências de ligações clandestinas de esgoto e despejo irregular no sistema de drenagem, com 69 intimações e 12 autuações (multas).
